L’Istituto storico della Resistenza di Pistoia svolge la sua attività in collaborazione con l’Istituto Storico della Resistenza in Toscana (ISRT), con la Rete degli Istituti Storici della Resistenza in Toscana, con la Regione Toscana, con le Istituzioni scientifiche e culturali, con il Comune di Pistoia e gli altri Comuni della Provincia, con la Provincia di Pistoia e con ogni altro soggetto pubblico e privato che ne condivida le finalità statutarie.